Paper Review : Database Management for Life Sciences Research

Jurnal oleh : H. V. Jagadish, Frank Olken Lawrence

Ilmu hayati menyediakan domain aplikasi yang kaya untuk penelitian pengelolaan data, dengan keragaman masalah yang luas yang dapat membuat perbedaan nyata dalam kemajuan dalam penelitian ilmu hayati. Salah satunya yaitu eksperimen biologi. Eksperimen biologi skala besar dan analisis datanya memerlukan sistem manajemen alur kerja untuk membantu melakukan pekerjaan dan mencatat rincian dari apa yang dilakukan terhadap setiap sampel dan datanya. Laboratorium WFMS (dikenal sebagai LIMS – sistem manajemen informasi laboratorium) dan sistem manajemen alur kerja komputasi (kadang-kadang disebut manajemen alur kerja ilmiah) diperlukan untuk proyek besar. Representasi eksplisit dan pencatatan protokol laboratorium dan komputasi berguna dalam mendorong analisis data otomatis dan pengambilan eksperimen berikutnya berdasarkan fitur protokol. Catatan rinci tentang eksperimen berguna untuk analisis hasil proses dan diagnosis kegagalan proses. Aliran kerja biologis berbeda dari alur kerja konvensional karena penyatuan dan pemisahan sampel adalah hal yang biasa.

Diharapkan pada masa yang akan datang, bahwa menjadi sebuah kepentingan bagi dokter dan ahli biologi eksperimental menjadi terlatih dalam metode komputasi, sama seperti pelatihan genetika yang sekarang telah menjadi rutinitas bagi para dokter. Biologi sering merupakan latihan induksi (generalisasi dari banyak contoh), sedangkan ilmu komputer lebih sering merupakan usaha deduktif, karena algoritma komputer / sistem biasanya dirancang, tidak berevolusi, dan artefak. Solusi untuk masalah pengelolaan data biologis tertentu kurang menarik bagi ilmuwan komputer daripada generalisasi masalah ini menjadi masalah pengelolaan data, yang semuanya dapat diselesaikan dalam satu gerakan melalui kemajuan komputasi yang sesuai. Dan memang begitu, karena paradigma ini secara signifikan lebih hemat biaya dalam aspek-aspek yang berlaku.  Hal ini karena desain eksperimental dan desain algoritma sering kali serupa.

Jurnal asli dapat diunduh disini

 

Advertisements

Leave a Reply

Fill in your details below or click an icon to log in:

WordPress.com Logo

You are commenting using your WordPress.com account. Log Out /  Change )

Google photo

You are commenting using your Google account. Log Out /  Change )

Twitter picture

You are commenting using your Twitter account. Log Out /  Change )

Facebook photo

You are commenting using your Facebook account. Log Out /  Change )

Connecting to %s